Linux中的環境變量是一種在操作系統中定義的全局變量，用于存儲各種系統和用戶配置信息。在Linux系統中，有兩種類型的環境變量，一種是系統環境變量，另一種是用戶環境變量。

系統環境變量是在操作系統啟動時加載的，它們對所有用戶都是可見的。這些變量通常包含一些重要的系統路徑和配置信息，比如Java的安裝路徑、系統庫路徑等。系統環境變量的設置是通過修改系統的配置文件來實現的，一般位于/etc目錄下的profile文件或者profile.d目錄中的腳本文件中。

用戶環境變量是每個用戶獨立設置的，只對該用戶有效。用戶環境變量通常包含一些個人化的配置信息，比如用戶的家目錄、個人腳本路徑等。用戶環境變量的設置是通過修改用戶的配置文件來實現的，一般位于用戶的家目錄下的.bashrc或者.profile文件中。

當系統環境變量和用戶環境變量出現沖突時，系統會按照一定的優先級規則進行處理。具體來說，系統環境變量的優先級高于用戶環境變量，即如果系統環境變量和用戶環境變量中存在同名的變量，系統會使用系統環境變量的值而不是用戶環境變量的值。

如果你想要解決Linux中的Java環境變量和系統環境變量的沖突問題，可以采取以下幾種方法：

1. 修改用戶環境變量：你可以在用戶的配置文件（如.bashrc或.profile）中設置Java環境變量，確保用戶環境變量中的Java路徑正確設置。這樣，在用戶登錄時，系統會加載用戶環境變量并覆蓋系統環境變量中的同名變量。

2. 修改系統環境變量：如果你希望系統范圍內都使用相同的Java環境變量，可以直接修改系統的配置文件（如/etc/profile或/etc/profile.d/java.sh）來設置Java環境變量。這樣，所有用戶登錄時都會加載系統環境變量中的Java路徑。

3. 使用軟鏈接：如果你不想修改系統或用戶的環境變量設置，還可以通過創建軟鏈接來解決沖突。你可以將Java的可執行文件鏈接到一個自定義的路徑中，并將該路徑添加到系統或用戶的環境變量中。這樣，當你執行Java命令時，系統會自動使用軟鏈接指向的Java路徑。

總結一下，Linux中的環境變量分為系統環境變量和用戶環境變量，當兩者存在沖突時，系統環境變量的優先級更高。為了解決Java環境變量和系統環境變量的沖突，你可以修改用戶環境變量、修改系統環境變量或者使用軟鏈接來指定Java路徑。選擇適合你需求的方法，可以有效解決這個問題。