一、ChEMBL 數據庫中數據庫中pChEMBL值的公式
在 ChEMBL 數據庫中,pChEMBL 值是一種用于表示化合物活性的常用指標。它是將原始活性值轉換為負對數(以10為底)的方式來表示化合物的活性。
pChEMBL 值的計算公式如下:
pChEMBL = -log10(activity)
其中,activity 是化合物的原始活性值。通常,活性值是以摩爾濃度、IC50、EC50、Ki 等形式表示的,具體取決于實驗測定方法。在計算 pChEMBL 值之前,應根據實驗結果中給出的活性單位進行適當的轉換和標準化。
通過將活性值轉換為 pChEMBL 值,可以更方便地比較和分析不同化合物的活性,并進行結構活性關系(Structure-Activity Relationship,SAR)的研究。pChEMBL 值的使用還有助于對活性值進行歸一化,以便更好地進行跨實驗和跨項目的比較和集成。
ChEMBL 數據庫中的 pChEMBL 值是根據實驗數據進行計算和提供的,并且可能涉及一些特定的數據處理和篩選方法。因此,在使用 pChEMBL 值時,應了解相關數據的來源和處理方法,并根據具體需求進行適當的解釋和分析。